Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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TRAF1Q13077 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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TRAF1Q13077 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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TRAF1Q13077 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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TRAF1Q13077 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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TRAF1Q13077 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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TRAF1Q13077 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAF1Q13077 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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