Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms