Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXI1Q12951 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms