Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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PTPN13Q12923 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PTPN13Q12923 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PTPN13Q12923 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PTPN13Q12923 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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