Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms