Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIPPLY1Q0D2K3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms