Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAMSAP2Q08AD1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAMSAP2Q08AD1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms