Protein–RNA interactions for Protein: Q08116

RGS1, Regulator of G-protein signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS1Q08116 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RGS1Q08116 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms