Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TFF3Q07654 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms