Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC9Q06265 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC9Q06265 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms