Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALD1Q05682 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms