Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRKCDQ05655 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRKCDQ05655 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms