Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MS4A2Q01362 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms