Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SKP1P63208 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SKP1P63208 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKP1P63208 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKP1P63208 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKP1P63208 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms