Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB25P57735 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB25P57735 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB25P57735 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB25P57735 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms