Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UBASH3AP57075 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBASH3AP57075 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms