Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
RAD23AP54725 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms