Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CLTCL1P53675 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLTCL1P53675 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms