Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMARCA2P51531 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
SMARCA2P51531 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SMARCA2P51531 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
SMARCA2P51531 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SMARCA2P51531 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMARCA2P51531 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMARCA2P51531 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMARCA2P51531 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMARCA2P51531 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMARCA2P51531 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMARCA2P51531 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMARCA2P51531 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms