Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT4P50991 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT4P50991 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT4P50991 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT4P50991 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT4P50991 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT4P50991 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT4P50991 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT4P50991 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT4P50991 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT4P50991 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT4P50991 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT4P50991 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT4P50991 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT4P50991 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT4P50991 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT4P50991 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT4P50991 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT4P50991 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCT4P50991 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCT4P50991 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCT4P50991 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCT4P50991 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCT4P50991 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT4P50991 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT4P50991 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms