Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBP2P50120 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBP2P50120 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBP2P50120 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms