Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTBP49356 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTBP49356 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTBP49356 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTBP49356 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNTBP49356 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTBP49356 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTBP49356 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTBP49356 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTBP49356 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTBP49356 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTBP49356 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTBP49356 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTBP49356 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTBP49356 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTBP49356 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNTBP49356 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNTBP49356 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNTBP49356 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNTBP49356 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms