Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK8P49336 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK8P49336 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK8P49336 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK8P49336 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK8P49336 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms