Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTRNP46939 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTRNP46939 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTRNP46939 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTRNP46939 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTRNP46939 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTRNP46939 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTRNP46939 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTRNP46939 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UTRNP46939 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTRNP46939 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTRNP46939 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTRNP46939 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UTRNP46939 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UTRNP46939 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
UTRNP46939 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
UTRNP46939 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UTRNP46939 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UTRNP46939 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms