Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA4P43681 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms