Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms