Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD13P35453 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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