Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXD12P35452 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms