Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFTPDP35247 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms