Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA11P31270 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA11P31270 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms