Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA10P31260 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms