Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CNGA1P29973 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNGA1P29973 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms