Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTKP29376 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTKP29376 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTKP29376 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTKP29376 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTKP29376 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTKP29376 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTKP29376 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTKP29376 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LTKP29376 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTKP29376 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LTKP29376 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTKP29376 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTKP29376 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTKP29376 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTKP29376 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTKP29376 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LTKP29376 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTKP29376 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTKP29376 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTKP29376 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTKP29376 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTKP29376 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTKP29376 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTKP29376 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTKP29376 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTKP29376 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTKP29376 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTKP29376 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTKP29376 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTKP29376 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTKP29376 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTKP29376 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTKP29376 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTKP29376 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms