Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2E1P29083 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms