Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJB2P29033 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJB2P29033 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJB2P29033 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GJB2P29033 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms