Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD10P28358 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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