Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHATP28329 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHATP28329 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHATP28329 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms