Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNMT1P26358 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms