Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APCP25054 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APCP25054 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APCP25054 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APCP25054 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms