Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RCC1P18754 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RCC1P18754 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RCC1P18754 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms