Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2A2P16615 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms