Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GNB3P16520 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB3P16520 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB3P16520 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB3P16520 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB3P16520 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB3P16520 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB3P16520 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB3P16520 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB3P16520 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB3P16520 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GNB3P16520 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GNB3P16520 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms