Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ITGA4P13612 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms