Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms