Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHGAP10645 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHGAP10645 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHGAP10645 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHGAP10645 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHGAP10645 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHGAP10645 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHGAP10645 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHGAP10645 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHGAP10645 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHGAP10645 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHGAP10645 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHGAP10645 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHGAP10645 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHGAP10645 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHGAP10645 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHGAP10645 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHGAP10645 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHGAP10645 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHGAP10645 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHGAP10645 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHGAP10645 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHGAP10645 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHGAP10645 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHGAP10645 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHGAP10645 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHGAP10645 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHGAP10645 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHGAP10645 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHGAP10645 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHGAP10645 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHGAP10645 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHGAP10645 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHGAP10645 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHGAP10645 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHGAP10645 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHGAP10645 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHGAP10645 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHGAP10645 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHGAP10645 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHGAP10645 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHGAP10645 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHGAP10645 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHGAP10645 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHGAP10645 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHGAP10645 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CHGAP10645 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHGAP10645 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHGAP10645 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.1 ms