Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms