Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CT47B1P0C2W7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms