Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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