Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NGFRP08138 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms