Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HLA-HP01893 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms